九寨沟大多数湖泊的形成源于水中所含碳酸钙。远古时代，地球处于冰期时，水中所含碳酸钙质无法凝结，只能随水漂流。到距今约 12000 年前，气候转暖后流水中的碳酸钙质活跃起来，一旦遇到障碍物便附着其上，逐渐积累，形成今天九寨沟中一条条乳白色的钙质堤埂，这些堤埂堆积起来形成堰塞湖。也就是所谓的“海子”。

九寨沟分三条沟：日则沟、树正沟、则查洼沟 3 条主沟。景观分布在树正、诺日朗、剑岩、长海、扎如、天海六大景区。